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1.
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1408435

ABSTRACT

Introducción: Los mapas microbiológicos se consideran un marcador epidemiológico pues resumen estadísticamente las bacterias circulantes y su comportamiento frente a los antibióticos en uso. Permiten establecer una política de antibióticos que garantiza el uso más racional de los antimicrobianos y disminuye el riesgo de resistencia bacteriana. Objetivos: Identificar las bacterias aisladas con mayor frecuencia a partir de cultivos microbiológicos de pacientes hospitalizados en el Instituto de Hematología e Inmunología durante el año 2020 y determinar la resistencia de las bacterias más frecuentes a los antimicrobianos ensayados, con vista a establecer el primer mapa microbiológico de la institución. Métodos: Se realizó un estudio de corte transversal que incluyó los cultivos de pacientes hospitalizados durante el año 2020. La identificación bacteriana se realizó según métodos convencionales y para determinar los perfiles de resistencia se empleó el método de Bauer-Kirby. Resultados: El hemocultivo fue el estudio microbiológico más indicado con una positividad de 32,80 por ciento. Predominaron las bacterias Gram negativas (81,71 por ciento), siendo las más identificadas Pseudomonas spp., Enterobacter spp., Klebsiella spp. y Escherichia coli. Entre las bacterias Gram positivas predominó Staphylococcus spp. coagulasa negativa. Se obtuvieron elevados porcentajes de resistencia frente a casi todos los antimicrobianos evaluados. Conclusiones: La realización del mapa microbiológico de la institución permite actualizar la política de uso de los antimicrobianos al identificar a los bacilos Gram negativos, con elevados porcentajes de resistencia, como los principales agentes etiológicos de las infecciones registradas en este centro de salud durante el año 2020(AU)


Introduction: Microbiological maps are considered an epidemiological marker as statistically summarize circulating bacteria and their behavior against antibiotics in use. They allow establishing an antibiotic policy that guarantees the most rational use of antimicrobials and decreases the risk of bacterial resistance. Objectives: Identify the isolated bacteria with more frequency from microbiological crops of hospitalized patients in the Institute of Hematology and Immunology during the year 2020 and determine the resistance of the most frequent bacteria to the antimicrobials tested, with a view to establishing the first microbiological map of the institution. Methods: An observational, descriptive, cross-sectional study was performed that included cultures of patients hospitalized during the year 2020. Bacterial identification was carried out according to conventional methods and to determine the resistance profiles was used by the Bauer-Kirby method. Results: The blood culture was the most indicated microbiological study with 32.80 percent positivity. The Gram negative bacteria predominated (81.71percent), being the most identified Pseudomona spp., Enterobacter spp., Klebsiella spp. and Escherichia coli. Among the Gram positive bacteria predominate Staphylococcus spp. coagulase negative. High percentages of resistance were obtained in front of almost all antimicrobials evaluated. Conclusions: The completion of the institutional microbiological map allows updating the antimicrobial use policy by identifying the Gram negative bacilli, with high percentages of resistance, as the main etiological agents of the infections registered in this health center during 2020(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Health Centers , Allergy and Immunology , Gram-Negative Bacteria , Hematology , Anti-Infective Agents
2.
Rev. chil. infectol ; 38(5): 678-687, oct. 2021. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1388301

ABSTRACT

ANTECEDENTES: Los biomarcadores actuales para el diagnóstico de sepsis neonatal tienen una exactitud limitada. El desarrollo de la medicina de precisión basada en tecnologías ómicas ofrece una oportunidad para mejorar el diagnóstico de la sepsis neonatal. OBJETIVOS: Evaluar la sensibilidad y especificidad de las pruebas basadas en tecnologías ómicas (metabolómica, proteómica y genómica/transcriptómica) para el diagnóstico de sepsis neonatal. METODOLOGÍA: Se realizó una revisión sistemática en bases de datos electrónicas. Se incluyeron estudios observacionales y ensayos clínicos que evaluaran las pruebas basadas en tecnologías ómicas en neonatos comparado con el cultivo para el diagnóstico de sepsis neonatal. Dos revisores independientes realizaron la evaluación de la calidad de los estudios y la extracción de los datos. Para el metaanálisis se realizó un modelo de efectos aleatorios y se planeó una evaluación de la heterogeneidad a través de un análisis de subgrupos por prueba ómica, edad gestacional y tiempo de establecimiento de la sepsis. RESULTADOS: Se observa expresión diferencial del genoma, proteoma y metaboloma entre los neonatos con y sin sepsis, identificando diferentes biomarcadores. El metaanálisis mostró una medida de resumen combinada para la sensibilidad de 0,88 (IC 95% 0,72-0,96), especificidad de 0,76 (IC 95% 0,62-0,85). CONCLUSIÓN: Las pruebas basadas en ómicas tienen una alta sensibilidad, siendo las de mejor rendimiento las basadas en genómica/transcriptómica. Los estudios tienen alta heterogeneidad.


BACKGROUND: Current biomarkers for the diagnosis of neonatal sepsis llave limited accuracy. The development of precision medicine based on omic's technologies offer an opportunity to improve the diagnosis of neonatal sepsis. AIM: To evalúate the sensitivity and specificity of tests based on omic technologies (metabolomics, proteomics and genomics) for the diagnosis of neonatal sepsis. METHODS: A systematic review was carried out in electronic databases. Observational studies and clinical trials evaluating tests based on omic technologies in neonates compared to culture for the diagnosis of neonatal sepsis were included. For the meta-analysis, a random effects model and an evaluation of heterogeneity were proposed through a subgroup analysis by omic test, gestational age and time of establishment of sepsis. RESULTS: Differential expression of the genome, proteome and metabolome is observed between neonates with and without sepsis, identifying different biomarkers. The meta-analysis showed a pooled summary measure for sensitivity of0.88 (95% CI 0.72, 0.96), specificity of0.76 (95% CI 0.62, 0.85). CONCLUSION: Omics-based tests have a high sensitivity, with the best performing ones being those based on genomics / transcriptomics. The studies have high heterogeneity.


Subject(s)
Humans , Infant, Newborn , Neonatal Sepsis/diagnosis , Biomarkers , Gestational Age , Sepsis/diagnosis , Precision Medicine
3.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1354891

ABSTRACT

Introducción. La resistencia antimicrobiana incrementa la morbimortalidad y es un problema serio en el mundo. Objetivo: Describir la resistencia antibiótica de bacterias aisladas en hemocultivos y Urocultivos en niños hospitalizados menores de 15 años. Material y Métodos: Estudio descriptivo ­ retrospectivo. La identificación bacteriana se hizo con VITEK XL, la susceptibilidad antibiótica con el CLSI. Resultados: Hemocultivos: Staphylococcus hominis 12,5% resistente a la Vancomicina. El Staphylococcus epidermidis, tuvo 100% de resistencia a Oxacilina y 0% resistencia a Vancomicina. Urocultivos: Klebsiella pneumoniae 0% resistencia a Amikacina, Gentamicina y Nitrofurantoina. La Escherichia Coli, tuvo resistencia para Amikacina 1,96%, Nitrofurantoina 3,92%. Conclusiones: E, Coli, resistencia menor de 6,25% para Amikacina y Nitrofurantoina. La Klebsiella pneumoniae, 0% de resistencia para Amikacina y Gentamicina. Hemocultivos: Estafilococo epidermidis, cero resistencia a Vancomicina. El Staphylococcus hominis, resistencia menor de 12% para Vancomicina y Rifampicina.


Introduction:Antimicrobial resistance increases morbidity and mortality and is a serious problem in the world. to describe the antibiotic resistance of Objective:bacteria isolated in blood and urine cultures in hospitalized children under 15 years of age. Descriptive - retrospective study. Bacterial Material and Methods:identification was made with VITEK XL, antibiotic susceptibility with CLSI. Results:Bloodcultures:Staphylococcushominis12.5%resistanttoVancomycin. Staphylococcus epidermidis had 100% resistance to Oxacillin and 0% resistance to Vancomycin. Urine cultures: Klebsiella pneumoniae 0% resistance to Amikacin, Gentamicin and Nitrofurantoin. Escherichia Coli, had resistance to Amikacin 1.96%, Nitrofurantoin 3.92%. E, Coli, resistance less than 6.25% for Amikacin Conclusions:andNitrofurantoin.Klebsiellapneumoniae,0%resistanceforAmikacinand Gentamicin.Bloodcultures:Staphylococcusepidermidis,zeroresistanceto Vancomycin. Staphylococcus hominis, resistance less than 12% for Vancomycin and Rifampicin.

4.
Rev. Cuerpo Méd. Hosp. Nac. Almanzor Aguinaga Asenjo ; 14(1): 8-12, ene.-mar 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1340677

ABSTRACT

RESUMEN Introducción. La resistencia antimicrobiana incrementa la morbimortalidad y es un problema serio en el mundo. Objetivo: Describir la resistencia antibiótica de bacterias aisladas en hemocultivos y Urocultivos en niños hospitalizados menores de 15 años. Material y Métodos: Estudio descriptivo - retrospectivo. La identificación bacteriana se hizo con VITEK XL, la susceptibilidad antibiótica con el CLSI. Resultados: Hemocultivos: Staphylococcus hominis 12,5% resistente a la Vancomicina. El Staphylococcus epidermidis, tuvo 100% de resistencia a Oxacilina y 0% resistencia a Vancomicina. Urocultivos: Klebsiella pneumoniae 0% resistencia a Amikacina, Gentamicina y Nitrofurantoina. La Escherichia Coli, tuvo resistencia para Amikacina 1,96%, Nitrofurantoina 3,92%. Conclusiones: E, Coli, resistencia menor de 6,25% para Amikacina y Nitrofurantoina. La Klebsiella pneumoniae, 0% de resistencia para Amikacina y Gentamicina. Hemocultivos: Estafilococo epidermidis, cero resistencia a Vancomicina. El Staphylococcus hominis, resistencia menor de 12% para Vancomicina y Rifampicina.


ABSTRACT Introduction: Antimicrobial resistance increases morbidity and mortality and is a serious problem in the world. Objective: to describe the antibiotic resistance of bacteria isolated in blood and urine cultures in hospitalized children under 15 years of age. Material and Methods: Descriptive retrospective study. Bacterial identification was made with VITEK XL, antibiotic susceptibility with CLSI. Results: Blood cultures: Staphylococcus hominis 12.5% resistant to Vancomycin. Staphylococcus epidermidis had 100% resistance to Oxacillin and 0% resistance to Vancomycin. Urine cultures: Klebsiella pneumoniae 0% resistance to Amikacin, Gentamicin and Nitrofurantoin. Escherichia Coli, had resistance to Amikacin 1.96%, Nitrofurantoin 3.92%. Conclusions: E, Coli, resistance less than 6.25% for Amikacin and Nitrofurantoin. Klebsiella pneumoniae, 0% resistance for Amikacin and Gentamicin. Blood cultures: Staphylococcus epidermidis, zero resistance to Vancomycin. Staphylococcus hominis, resistance less than 12% for Vancomycin and Rifampicin.

5.
Medicina (B.Aires) ; 80(supl.6): 44-47, dic. 2020. graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1250318

ABSTRACT

Abstract The Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) pandemic has strained the world's health systems, highlighting the need to optimize its clinical management and treatment. The usefulness of blood cultures in patients with COVID-19 pneumonia has not been proved. We aim to describe the diagnostic yield of early blood cultures in patients with COVID-19 pneumonia in a public hospital in Buenos Aires City. This descriptive observational study included all adult patients with COVID-19 pneumonia admitted to the Internal Medicine ward of Hospital Durand between April 1, 2020 and July 30, 2020, who had blood cultures drawn within 5 days from hospital admission. Among 267 patients hospitalized with COVID-19 pneumonia, 38 had early blood cultures drawn. No clinically relevant microorganism was isolated from blood and contaminant microorganisms were recovered in 7 (18.4%) patients. This study found no evidence of bacteremia in patients with COVID-19 pneumonia. Furthermore, the rate of contaminated blood cultures nearly doubles the reported in patients with community acquired pneumonia (10%), which may be explained by unfamiliarity of additional personal protective equipment worn by healthcare workers. Our results advocate against the routine indication of blood cultures upon admission to the Internal Medicine Ward of patients with COVID-19 pneumonia. We suggest that blood cultures could only be useful in case of clinical deterioration or suspected hospital-acquired infection.


Resumen La pandemia por COVID-19 ha puesto en jaque a los sistemas de salud del mundo, priorizando la necesidad de optimizar su manejo clínico. Aunque los protocolos de varios hospitales de nuestro país para COVID-19 incluyen hemocultivo al ingreso, no se ha demostrado su utilidad en pacientes con neumonía por COVID-19. Nuestro objetivo fue describir el rédito diagnóstico de los hemocultivos tempranos en pacientes con neumonía por COVID-19 en un hospital público de la Ciudad de Buenos Aires. Este estudio observacional descriptivo incluyó todos los pacientes adultos ingresados en la sala de Clínica Médica del Hospital Durand entre el 1 de abril y el 30 de julio de 2020, con neumonía por COVID-19 y hemocultivos realizados dentro de los 5 días del ingreso. De los 267 pacientes con neumonía por COVID-19, a 38 se les realizó hemocultivos tempranos. No se aisló ningún microorganismo clínicamente relevante en ninguno de ellos y se recuperaron microorganismos contaminantes en 7 (18.4%). Este estudio no encontró evidencia de bacteriemia en pacientes con neumonía por COVID-19. Además, la tasa de hemocultivos contaminados casi duplicó la tasa en pacientes con neumonía adquirida en la comunidad, lo que probablemente se deba a la falta de familiaridad de equipos de protección personal adicional utilizado por el personal de salud. Nuestros resultados abogan en contra de la realización rutinaria de hemocultivos al ingreso de pacientes con neumonía por COVID-19. Sugerimos que los hemocultivos solo sean utilizados ante el deterioro clínico o la sospecha de infección intrahospitalaria.


Subject(s)
Humans , Adult , Pneumonia/diagnosis , COVID-19 , Pandemics , Blood Culture , SARS-CoV-2
6.
Rev. chil. infectol ; 37(5): 570-576, nov. 2020. tab, graf
Article in Spanish | LILACS, BNUY, UY-BNMED | ID: biblio-1144253

ABSTRACT

Resumen Introducción: La endocarditis infecciosa (EI) es causa importante de morbimortalidad. En los últimos años se han visto cambios en la epidemiología de esta enfermedad. Objetivo: Describir las características epidemiológicas, clínicas y microbiológicas de pacientes con diagnóstico de EI ingresados en un hospital pediátrico de 2011 al 2018. Pacientes y Método: Estudio observacional, descriptivo, retrospectivo. Se incluyeron pacientes bajo 15 años de edad, hospitalizados con EI en un hospital pediátrico de referencia de Uruguay. Se utilizaron cálculos de medidas de tendencia central y dispersión, así como frecuencias absolutas y porcentuales. Resultados: Se identificaron 11 niños, media de edad 4 años 6 meses (rango 5 meses - 13 años). Cinco sin factores de riesgo, seis con factores de riesgo: cinco con cardiopatía congénita (2 con cirugía cardíaca) y uno con catéter venoso central. En 11 se obtuvo hemocultivo previo a la antibioterapia, en 10 una sola muestra, en uno hubo dos muestras. En nueve casos se recuperó el microorganismo causal; Staphylococcus aureus en cuatro (dos cepas resistentes a meticilina), seguido de Streptococcus grupo viridans tres niños. En 10 niños se encontraron vegetaciones en el ecocardiograma, seis valvulares. El tratamiento empírico más frecuente fue ceftriaxona y vancomicina. Las complicaciones fueron falla cardiaca y embolias sépticas. Cinco niños requirieron cirugía cardíaca. Falleció un paciente. Conclusiones: Se observó un aumento de EI en niños sin cardiopatía, por tanto, es necesario tener alta sospecha clínica en pacientes febriles. Importante es realizar hemocultivos previos al inicio de la antibioterapia y contemplar una cobertura contra Staphylococcus aureus en la terapia empírica inicial.


Abstract Background: Infective endocarditis (IE) is an important cause of morbidity and mortality. In recent years there have been changes in the epidemiology of this disease. Aim: To describe epidemiological, clinical and microbiological characteristics of patients with a diagnosis of IE admitted to a pediatric hospital from 2011 to 2018. Methods: Observational, descriptive, retrospective study. Children under 15 years of age hospitalized with IE in a reference pediatric hospital in Uruguay were included. Calculations of measures of central tendency and dispersion were used, as well as absolute and percentage frequencies. Results: 11 children were identified, mean age 4 years 6 months (range 5 months - 13 years). Five without risk factors, 6 with risk factors: 5 congenital heart disease (2 with cardiac surgery) and 1 central venous catheter. In 11 blood cultures were obtained prior to antibiotics, 10 a single sample, 1 with two samples. In 9 cases a microorganism was isolated. The most frequent was Staphylococcus aureus 4 children (2 methicillin resistant), followed by group viridans Streptococcus 3 children. In 10 children vegetations were found in the echocardiogram, 6 valvular. The most frequent empirical treatment was ceftriaxone and vancomycin. Complications were heart failure and septic emboli. 5 children required heart surgery. One patient died. Conclusions: An increase of IE in children without heart disease has been observed, then, it is necessary to have high clinical suspicion in febrile patients. It is important to perform blood cultures prior to the start of antibiotics and to consider coverage against Staphylococcus aureus in empirical initial treatment.


Subject(s)
Humans , Male , Child, Preschool , Child , Adolescent , Staphylococcal Infections/drug therapy , Staphylococcal Infections/epidemiology , Endocarditis, Bacterial/drug therapy , Endocarditis, Bacterial/epidemiology , Uruguay/epidemiology , Retrospective Studies
7.
Cuad. Hosp. Clín ; 61(1): [9], jul. 2020. ilus.
Article in Spanish | LIBOCS, LILACS | ID: biblio-1118905

ABSTRACT

OBJETIVO: informar acerca de un caso de endocarditis bacteriana. Paciente varón de 34 años de edad, con único antecedente de rinitis alérgica con tratamiento irregular. Él es procedente de Valparaiso Chile, se encuentra en sus vacaciones en la ciudad de La Paz, acude al servicio de medicina interna ­ emergencias, con clínica compatible con edema agudo de pulmón de la altura y edema cerebral de la altura, asociado a sepsis de foco pulmonar, que progresa a choque séptico, durante su internación intercurre con alzas térmicas continuas, asociado a hallazgo ecocardiográfico de vegetación en ventrículo derecho con hemocultivo positivo, por lo que se llega al diagnóstico de endocarditis bacteriana, se realizó el tratamiento correspondiente, y resolución del cuadro.


OBJECTIVE: to report a case of bacterial endocarditis A 34-year-old male patient with a unique history of allergic rhinitis with irregular treatment. He comes from Valparaiso Chile, is on vacation in the city of La Paz, goes to the service of internal medicine - emergencies with compatible clinical with acute pulmonary edema of height and cerebral edema of height, associated with sepsis of focus pulmonary disease, which progresses to septic shock, during internment with continuous hyperthermia, associated vegetation in right ventricle for echocardiography, also positive blood culture, so that a diagnosis of bacterial endocarditis is reached, Corresponding treatment was carried out, and resolution of pathology..


Subject(s)
Male , Adult , Pulmonary Edema , Shock, Septic , Endocarditis, Bacterial , Pathology , Echocardiography , Lung
8.
Kasmera ; 48(1): e48128122019, ene-jun 2020.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1103157

ABSTRACT

Para determinar la susceptibilidad a meticilina y vancomicina en cepas de Staphylococcus aureus aisladas de hemocultivos, se analizaron los registros de pacientes ingresados en las Unidades de Cuidados Intensivos del Servicio Autónomo Hospital Universitario de Maracaibo durante el período enero 2011-diciembre 2015. Se procesaron 35.341 hemocultivos; 5.072 (14,35%) fueron positivos; en 455 (8,97%) se aislaron 96 cepas de Staphylococcus aureus (21,09%), de las cuales, 78 (81,25%) fueron resistentes y 18 (18,75%), sensibles a meticilina. Todos los aislados resultaron sensibles a vancomicina. El 61,45% de las cepas expresó multirresistencia. No se encontró diferencia estadísticamente significativa en la frecuencia de aislamiento de Staphylococcus aureus por año, edad y sexo del paciente (p > 0,05); pero si según el tipo de unidad y la presencia de co-resistencia antimicrobiana (p < 0,05). Los elevados niveles de resistencia a meticilina y la evidencia de fenotipos sensibles a vancomicina con valores elevados de concentración inhibitoria mínima (> 1 µg/ml), demandan la vigilancia sistemática del patrón de susceptibilidad antimicrobiana a fin de guiar a los clínicos para elegir la terapia empírica adecuada, contribuyendo al reforzamiento continuo de las precauciones estándar y al establecimiento de las políticas locales de administración y regulación del uso de antimicrobianos


To determine susceptibility to methicillin and vancomycin in blood-isolated strains of Staphylococcus aureus isolated from blood cultures, patient records entered in the Intensive Care Units of the Autonomous Hospital University Service of Maracaibo were analyzed during the period January 2011-December 2015. 35,341 blood cultures were processed; 5.072 (14,35%) were positive; in 455 (8.97%)96 strains of Staphylococcus aureus (21.09%) were isolated, of which 78 (81.25%) were resistant and 18 (18.75%), sensitive to methicillin. All isolates were sensitive to vancomycin. 61.45% of the strains expressed multi-resistance. No statistically significant difference in the frequency of isolation of Staphylococcus aureus per year, age and sex of the patient (p > 0.05) was found; but if according to the type of unit and the presence of antimicrobial co-resistance (p ˂ 0.05). The high levels of methicillin resistance and the evidence of vancomycin-sensitive phenotypes with high minimum inhibitory concentration values (>1 µg/ml), require systematic monitoring of the antimicrobial susceptibility pattern in order to guide clinicians to choose appropriate empirical therapy, contributing to the continuous strengthening of standard precautions and the establishment of local policies for the administration and regulation of the use of antimicrobials

9.
Rev. cuba. med. mil ; 49(2): e292, abr.-jun. 2020. fig
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1138998

ABSTRACT

Introducción: A partir de los años 50, la presentación clínica clásica de la endocarditis infecciosa ha variado. Debido al uso de antibióticos, drogas ilícitas, catéteres venosos, etc., las manifestaciones tradicionales no son frecuentes. Objetivo: Presentar un caso con endocarditis infecciosa y comentar las manifestaciones embolígenas, así como las medidas preventivas con las nuevas técnicas. Caso clínico: Enfermo con insuficiencia renal crónica, diabético, hipertenso, con catéter venoso central, que presentó, después de una sección de hemodiálisis; escalofríos intensos, fiebre de 39,5 0C, cefalea intensa, toma del estado general, dolor torácico intenso punzante, tos, expectoración con sangre roja rutilante, disnea, soplo regurgitante holosistólico. Se le realizó ecocardiograma dópler que muestra múltiples vegetaciones pequeñas, hemocultivos positivos a estafilococos dorado. Fue tratado según los resultados del antibiograma durante 6 semanas y resolvió su extrema gravedad. Conclusiones: La endocarditis infecciosa puede tener manifestaciones muy diferentes al de décadas anteriores; puede aparecer como cuadro agudo fulminante por manifestaciones embólicas y sépticas múltiples(AU)


Introduction: Since the 1950s, the classical clinical presentation of infectious endocarditis (E.I) has varied. Due to the use of antibiotics, illicit drugs, venous catheters, traditional manifestations are not frequent. Objectives: To review the embolic presentation of endocarditis and pecify the preventive measures with the new techniques. Clinical case: A patient with chronic renal insufficiency, diabetic, hypertensive, with central venous catheter, intense chills, fever of 39.5 ° C, intense headache, general state, severe chest pain, cough, expectoration with bright red blood, dyspnea, holosystolic regurgitant murmur, after a section of hemodialysis. Doppler echocardiogram was performed, visualizing multiple small vegetation's, positive blood cultures to golden staphylococci, treatment according to antibiograms for 6 weeks, at the end of which the extreme severity was resolved. Comments: Infective endocarditis can have a very different behavior from previous decades; it can appear as an acute fulminating disease due to embolic, septic, multiple manifestations(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Middle Aged , Chest Pain , Microbial Sensitivity Tests , Renal Dialysis/instrumentation , Dyspnea/complications , Renal Insufficiency, Chronic/diagnosis
10.
Rev. cientif. cienc. med ; 23(2): 161-165, 2020.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1358284

ABSTRACT

La sepsis neonatal vertical y su diagnóstico continúan siendo un desafío en recién nacidos, los factores de riesgo y la clínica juegan un rol importante para su mejor interpretación, sin embargo la clínica continúa siendo inespecífica junto a las limitadas pruebas laboratoriales entre las cuales se encuentra la proteína C reactiva, el cual aún se continúa usando en nuestro entorno. OBJETIVO: determinar la utilidad de la proteína C reactiva frente a hemocultivos negativos en sepsis neonatal vertical sintomática asociada a factores de riesgo, en el servicio de neonatología del Hospital Obrero Número 2; de enero de 2018 a enero de 2019. METODOLOGÍA: un estudio descriptivo, observacional, longitudinal y analítico; la muestra fue dada por 153 neonatos que cumplieron con los criterios de inclusión. Se realizó recolección de datos perinatales, clínicos, laboratoriales y factores de riesgo, además de uso de cuadros estadísticos. RESULTADOS: el hemocultivo sigue siendo el Gold estándar sin embargo la PCR es de utilidad para una conducta precoz. El género masculino con alto porcentaje (61%) de presentación de sepsis, RPM 41 %, corioamnionitis 39% y prematuridad 39% como factores de riesgo predisponentes CONCLUSIÓN: esta investigación indica la importancia de conocer los factores de riesgo, clínica sugestiva y el uso laboratorios como la PCR, que en conjunto nos ayudan a concluir en el diagnóstico de sepsis de manera precoz, en presencia de hemocultivos negativos y nos permite realizar un mejor seguimiento.


Vertical neonatal sepsis and its diagnosis continue to be a challenge in newborns, risk factors and the clinic play an important role for its better interpretation, however, the clinical picture continues to be nonspecific together with the limited laboratory tests, among which is the C-reactive protein, which is still used in our environment. OBJECTIVE: to determine the usefulness of C-reactive protein against negative blood cultures in symptomatic vertical neonatal sepsis associated with risk factors, in the neonatology service of Hospital Obrero Número 2; from January 2018 to January 2019. METHODOLOGY: a descriptive, observational, longitudinal and analytical study; the sample was given by 153 neonates who met the inclusion criteria. Perinatal, clinical, laboratory data and risk factors were collected, as well as the use of statistical tables. RESULTS: blood culture continues to be the Gold standard, however CRP is useful for early conduct. The male gender with a high percentage (61%) of presenting sepsis, PROM 41%, chorioamnionitis 39% and prematurity 39% as predisposing risk factors. CONCLUSION: this research indicates the importance of knowing the risk factors, suggestive symptoms and the use Laboratories such as PCR, which together help us to conclude the diagnosis of sepsis early, in the presence of negative blood cultures and allow us to carry out a better follow-up.


Subject(s)
Infant, Newborn , Neonatal Sepsis , C-Reactive Protein , Neonatology
11.
Rev. cuba. invest. bioméd ; 37(1): 11-21, ene.-mar. 2018. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-991087

ABSTRACT

La bacteriemia es una complicación grave de las infecciones bacterianas. Un diagnóstico temprano del microorganismo responsable permite aplicar tratamientos efectivos en menor intervalo de tiempo. Los hemocultivos son diagnosticadores clínicos diseñado para este fin. Objetivo: Realizar un estudio de estabilidad acelerado de un lote del hemocultivo HemoCen Aerobio que permita planificar su diseño en estante en condiciones reales. Métodos: Se formuló un lote del hemocultivo HemoCen Aerobio en el Centro Nacional de Biopreparados, BioCen y se envasó asépticamente en los Laboratorios Biológicos Farmacéuticos, LABIOFAM. Se llevó a cabo un estudio de estabilidad acelerado por el Método de Arrenhius. Los frascos se conservaron durante 120 días a 15 °C, 30 °C y 50 °C. Se realizaron evaluaciones físico-químicas, organolépticas y capacidad de promoción de crecimiento de Staphylococcus aureus ATCC 25923 a los 7, 15, 30, 60 y 120 días. Resultados: El estudio de estabilidad demostró que el pH y el color del medio se deterioran progresivamente en el tiempo cuando las temperaturas aumentan entre 30 °C y 50 °C. La promoción de crecimiento de Staphylococcus aureus resultó favorable con índices de recuperación entre 20 y 40 UFC·frasco-1. Discusión: HemoCen Aerobio resulta funcional con un desempeño analítico satisfactorio, cuyos índices de recuperación microbiana se encuentran acorde a los valores reportados en bacteriemias de escasa magnitud. Estos resultados sientan las bases para planificar un estudio de estabilidad en estante en condiciones reales. Conclusión: Se estima un período de validez de 2 años(AU)


Bacteremia is a serious complication of bacterial infections. Early diagnosis of the causative organism allows applying appropriate treatments in a shorter time interval. Hemocultures are clinical diagnosticians designed for this purpose. Objective: Perform an accelerated stability study of a batch of HemoCen Aerobic hemoculture that allows planning its shelf designed in true conditions. Methods: A batch of HemoCen Aerobic hemoculture was formulated at the National Bioproducts Center, BioCen, and aseptically packaged at the Biological Pharmaceutical Laboratories, LABIOFAM. An accelerated stability study was carried out by the Arrenhius Method. The bottles were stored for 120 days at 15 °C, 30 °C and 50 °C. Physicochemical, organoleptic and growth promotion capacity evaluations of Staphylococcus aureus ATCC 25923 were realized at 7, 15, 30, 60 and 120 days. Results: The stability study demonstrated that the pH and the color of the medium progressively deteriorate over time as temperatures increase between 30 °C and 50 °C. Growth promotion of Staphylococcus aureus was favorable with recovery rates between 20 and 40 CFU bottle-1. Discussion: HemoCen Aerobic is functional with a satisfactory analytical performance, which recovery rates are consistent with the values reported in bacteremia of low magnitude. These results provide the basis for planning a shelf stability study under real conditions. Conclusion: A durability period of 2 years was estimated(AU)


Subject(s)
Humans , Bacteremia/diagnosis , Early Diagnosis , Blood Culture/methods
12.
Rev. ecuat. pediatr ; 18(2): 5-7, diciembre 2017.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-996583

ABSTRACT

Introducción. La neonatología del Hospital de los Valles (HDLV) es un centro de referencia para atención de cuarto nivel. Las infecciones asociadas a la atención de salud (IAAS) contribuyen a la mortalidad de los recién nacidos en la Región de las Américas, especialmente de aquellos más vulnerables. Se reportan importantes diferencias en la incidencia de IAAS en las Unidades de Cuidados Intensivos Neonatales (UCI NEO), así, en Estados Unidos, las tasas varían desde el 6% a más altas del 40% en la Región de las Américas, hay pocos datos disponibles, pero son frecuentes la información de brotes en estas UCI NEO, con repercusión en la opinión pública, generalmente, por la alta letalidad. Materiales y Métodos. Este es un estudio, observacional y descriptivo que incluye todos los pacientes nacidos, transferidos e ingresados en cuidado intensivo del área de neonatología del HDLV desde el primero de enero del 2015 hasta el 31 de diciembre del 2017. Los datos son registrados y analizados en Excel. Resultados. Entre enero del 2015 a diciembre del 2017 se registraron 1016 pacientes de los cuales 318 son ingresados al área de cuidado intensivo, la edad gestacional más común de los pacientes en estudio corresponde al periodo comprendido entre 28 y 32 semanas. El total de pacientes con reporte de cultivos positivos es de 44 casos que corresponde al 4.3% del total de pacientes registrados. El mayor número de casos está relacionado con 11 casos de Klebsiella Neumoniae y 8 casos con Klebsiella Neumoniae BLEE. La mayoría de las infecciones están relacionadas con menores de 1000 gramos y con una edad gestacional entre 28 y 32 semanas. Conclusión. La neonatología del HDLV presta atención prioritariamente a pacientes de menos de 28 semanas de edad gestacional y pacientes con patología quirúrgica grave, sin embargo, según los datos previos la incidencia de procesos infecciosos tiene tendencia a mantenerse antes que a incrementar con la mayor complejidad de las enfermedades de los pacientes transferidos


Introduction. The neonatology of the Hospital de los Valles (HDLV) is a reference center for fourth level care. Infections associated with health care (IAAS) contribute to the mortality of newborns in the Region of the Americas, especially those most vulnerable. Important differences are reported in the incidence of IAAS in the Neonatal Intensive Care Units (UCI NEO), thus, in the United States, the rates vary from 6% to higher than 40% in the Region of the Americas. There is few data available, but information about outbreaks in these NEO UCIs is frequent, with repercussions on public opinion, generally, due to high lethality. Materials and methods. This is an observational and descriptive study that includes all the patients born, transferred and admitted to intensive care in the HDLV neonatology area from January 1, 2015 to December 31, 2017. The data is recorded and analyzed in Excel. Results Between January 2015 and December 2017, 1016 patients were registered, of which 318 were admitted to the intensive care area; the most common gestational age of the patients in the study corresponds to the period between 28 and 32 weeks. The total number of patients reporting positive cultures is 44 cases, corresponding to 4.3% of the total number of registered patients. The largest number of cases is related to 11 cases of Klebsiella pneumoniae and 8 cases with Klebsiella pneumoniae BLEE. The majority of infections are related to children under 1000 grams and with a gestational age between 28 and 32 weeks. Conclusion. HDLV neonatology gives priority attention to patients less than 28 weeks gestational age and patients with severe surgical pathology, however, according to the previous data the incidence of infectious processes has a tendency to be maintained instead of increasing with the greater complexity of the diseases of transferred patients.


Subject(s)
Humans , Infant, Newborn , Infant, Newborn , Cross Infection , Neonatal Sepsis , Klebsiella Infections , Infant, Premature , Child Health Services , Blood Culture
13.
Med. interna Méx ; 33(1): 28-40, ene.-feb. 2017. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-894232

ABSTRACT

Resumen ANTECEDENTES: la sepsis se define como la existencia posible o documentada de una infección junto con manifestaciones sistémicas de infección. El hemocultivo es el estudio de primera línea en pacientes con sospecha de infección; el objetivo principal de los hemocultivos consiste en confirmar bacteremia. En la bibliografía se reporta que la sensibilidad para el diagnóstico de bacteremias es baja, con crecimiento en cultivos menor a 10%; en otras palabras, los hemocultivos son positivos en únicamente una tercera parte de los casos. OBJETIVO: determinar la tasa de hemocultivos positivos en el Hospital Ángeles Pedregal de la Ciudad de México, así como describir los microorganismos encontrados con mayor frecuencia y sus resistencias. MATERIAL Y MÉTODO: estudio retrospectivo, observacional y descriptivo, en el que se revisaron todos los hemocultivos realizados en el hospital citado, de enero a diciembre de 2015. RESULTADOS: de la muestra total (1,598 hemocultivos), únicamente 213 resultaron positivos, con lo que se reportó una probabilidad de éxito de 13%. Los microorganismos más frecuentes fueron Escherichia coli (43%), de los que 35 (16%) fueron organismos resistentes (BLEE), Burkholderia cepacia (6%) y Enterococcus faecalis (5%) en el grupo de los gramnegativos y Staphylococcus epidermidis (9%) y Staphyloccocus aureus (6%) en el grupo de los grampositivos. CONCLUSIONES: el número de hemocultivos que resultan positivos en el Hospital Ángeles Pedregal de la Ciudad de México es ligeramente mayor al reportado en la bibliografía. Además, se encontró mayor positividad para Escherichia coli, lo que confirma que las poblaciones de microorganismos son diferentes en cada hospital.


Abstract BACKGROUND: Sepsis is defined as the possible or documented presence of infection along with systemic manifestations of infection. Blood culture is the first-line study in patients with suspected infection, the main objective of blood cultures consists of confirming bacteremia. Literature reports that sensitivity for diagnosis of bacteremias is low, with a growth in crops <10%; in other words, blood cultures are positive in only 1/3 of the cases. OBJECTIVES: To determine the rate of positive blood cultures at Hospital Angeles Pedregal, Mexico City, as well as to describe the most commonly found microorganisms and their resistances. MATERIAL AND METHOD: A descriptive observational retrospective study was carried out. We reviewed all blood cultures performed at the Hospital Angeles Pedregal, Mexico, City, from January 2015 to December 2015. RESULTS: Of the total sample (1,598 blood cultures), only 213 were positive, finding a probability of success of 13%. The most common microorganisms were Escherichia coli (43%) of whom 35 (16%) were resistant organisms (BLEE), Burkholderia cepacia (6%) and Enterococcus faecalis (5%) in the gram-negative group. Staphylococcus epidermidis (9%) and Staphyloccocus aureus (6%) in the gram-positive group. CONCLUSIONS: Number of blood positive cultures at Hospital Angeles Pedregal, Mexico City, is slightly higher than that reported in literature. In addition, more positivity was found for Escherichia coli, confirming that the populations of microorganisms will be different at each hospital.

14.
Rev. cuba. oftalmol ; 29(4): 728-734, oct.-dic. 2016. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-845057

ABSTRACT

La endoftalmitis endógena es una enfermedad ocular infrecuente pero grave. Su manejo ha de ser necesariamente multidisciplinario por la complejidad de la afección sistémica, dirigido a erradicar el foco infeccioso primario, conocido o no, así como a preservar la función visual. Se presenta a un paciente masculino diabético de 66 años, ingresado en un hospital general para tratamiento quirúrgico de úlcera séptica del pie derecho, quien debutó con endoftalmitis endógena anterior difusa por Staphylococcus aureus confirmado mediante cultivos de humor acuoso y sangre. Aunque inicialmente se pensó en uveítis anterior aguda, la presencia de foco séptico en partes blandas y el empeoramiento del cuadro clínico oftalmológico fueron los elementos que condujeron al diagnóstico de la endoftalmitis endógena. La actuación conjunta de varias especialidades médicas hizo posible el manejo satisfactorio del paciente(AU)


Endogenous endophthalmitis is a rare but serious pathology. A multidisciplinary care team should lead the treatment because of the complexity of the systemic affection, in order to eradicate the primary infectious focus, either known or not, and to preserve the visual function. This a 66 years old male diabetic patient who was admitted to a general hospital with the purpose of practicing surgery of the right foot septic ulcer, who began suffering diffuse anterior endogenous endophthalmitis caused by Staphylococcus aureus, and confirmed through aqueous humor and blood cultures. Although the initial diagnosis was acute anterior uveitis, the presence of a septic focus in the soft tissue and the worsening of clinical ophthalmological symptoms led to finally diagnose him with endogenous endophthalmitis. The joint performance of several medical specialists made the satisfactory management of this patient possible(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Aged , Corneal Edema/therapy , Endophthalmitis/diagnosis , Staphylococcus aureus/cytology , Ultrasonography/methods
16.
Rev. chil. infectol ; 33(2): 150-158, abr. 2016. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-784865

ABSTRACT

Background: Positive blood cultures usually indicate disseminated infection that is associated with a poor prognosis and higher mortality. We seek to develop and validate a predictive model to identify factors associated with positive blood cultures in emergency patients. Methods: Secondary analysis of data from two prospective cohorts (EPISEPSIS: developing cohort, and DISEPSIS: validation cohort) of patients with suspected or confirmed infection, assembled in emergency services in 10 hospitals in four cities in Colombia between September 2007 and February 2008. A logistic multivariable model was fitted to identify clinical and laboratory variables predictive of positive blood culture. Results: We analyzed 719 patients in developing and 467 in validation cohort with 32% and 21% positive blood cultures, respectively. The final predictive model included variables with significant coefficients for both cohorts: temperature > 38° C, Glasgow < 15 and platelet < 150.000 cells/mm³, with calibration (goodness-of-fit H-L) p = 0.0907 and p = 0.7003 and discrimination AUC = 0.68 (95% CI = 0.65-0.72) and 0.65 (95% CI = 0.61-0.70) in EPISEPSIS and DISEPSIS, respectively. Specifically, temperature > 38 °C and platelets < 150.000 cells/mm³ and normal Glasgow; or Glasgow < 15 with normal temperature and platelets exhibit a LR between 1,9 (CI 95% = 1,2-3,1) and 2,3 (CI 95% = 1,7-3,1). Glasgow < 15 with any of low platelets or high temperature shows a LR between 2,2 (CI 95% = 1,1-4,4) and 2,6 (CI 95% = 1,7-4,3). Discussion: Temperature > 38° C, platelet count < 150,000 cells/mm³ and GCS < 15 are variables associated with increased likelihood of having a positive blood culture.


Introducción: Un hemocultivo positivo usualmente indica infección diseminada, la que se asocia con peor pronóstico y mayor mortalidad. Por tanto, buscamos desarrollar y validar un modelo de predicción que permita identificar los factores asociados con la positividad de los hemocultivos en pacientes del servicio de urgencias. Métodos: Análisis secundario de datos de dos cohortes prospectivas (EPISEPSIS: cohorte de desarrollo y DISEPSIS: cohorte de validación) de pacientes con sospecha o confirmación de infección, ensambladas en servicios de urgencias de 10 instituciones hospitalarias en cuatro ciudades de Colombia entre septiembre de 2007 y febrero de 2008. Se ajustó un modelo logístico multivariado para identificar variables clínicas y de laboratorio predictoras de hemocultivos positivos. Resultados: Se analizaron 719 pacientes en la cohorte de desarrollo y 467 en la cohorte de validación, con 32 y 21% de hemocultivos positivos, respectivamente. El modelo predictor final incluyó las variables con coeficientes significativos para ambas cohortes: temperatura ≥ 38 °C, Glasgow < 15 y plaquetas ≤ 150.000 céls/mm³ con calibración (bondad de ajuste de H-L) p = 0,0907 y p = 0,7003 y discriminación AUC: 0,68 (IC 95%: 0,65-0,72) y 0,65 (IC 95%: 0,61-0,70) en EPISEPSIS y DISEPSIS, respectivamente. Temperatura ≥ 38 °C y recuento de plaquetas ≤ 150.000 céls/mm³ con Glasgow normal; o Glasgow < 15 con temperatura y plaquetas normales tiene un LR entre 1,9 (IC 95%: 1,2-3,1) y 2,3 (IC 95%: 1,7-3,1). La escala de Glasgow < 15 puntos junto con cualquiera entre recuento de plaquetas o temperatura alteradas tiene un LR entre 2,2 (IC 95%: 1,1-4,4) y 2,6 (IC 95%: 1,7-4,3). Discusión: La temperatura ≥ 38 °C, el recuento de plaquetas ≤ 150.000 céls/mm³ y la escala de Glasgow < 15 son las variables asociadas con mayor probabilidad de tener un hemocultivo positivo.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Aged , Bacteria/isolation & purification , Bacteremia/diagnosis , Blood Culture/methods , Reference Values , Blood Cell Count , Body Temperature , Glasgow Coma Scale , Logistic Models , Predictive Value of Tests , Prospective Studies , Reproducibility of Results , Risk Factors , Bacteremia/blood , Emergency Service, Hospital
17.
Rev. chil. pediatr ; 86(5): 337-344, oct. 2015. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-771647

ABSTRACT

Introducción: La sepsis es causa importante de morbimortalidad neonatal. Objetivos: Detectar el tiempo en que la curva de crecimiento bacteriano es evidenciada en la muestra de sangre inoculada en los hemocultivos y comparar estos tiempos de crecimiento bacteriano entre bacterias gramnegativas y grampositivas, entre los tipos de sepsis neonatal y determinar las bacterias más frecuentemente aisladas entre neonatos prematuros y de término. Pacientes y método: Estudio descriptivo de recién nacidos en riesgo de sepsis o con sospecha de sepsis por manifestaciones clínicas o de laboratorio, en que se evaluaron 114 hemocultivos positivos entre 1.932 hemocultivos tomados entre mayo de 2010 y mayo de 2014. Los datos se analizaron con Stata® 11.0. Resultados: El 5,9% de los hemocultivos tuvieron crecimiento bacteriano. La mediana y rango intercuartílico de tiempos de crecimiento bacteriano para gramnegativos fue 11 h (10-13 h), para grampositivos diferentes a Staphylococcus coagulasa negativo (SCoN) 12 h (12-18 h) y para SCoN 42h (36-44h). El 95,8% de las bacterias grampositivas y el 96% de las gramnegativas tuvieron tiempos de crecimiento bacteriano ≤ 24 h de incubación, mientras que en los SCoN el 100% de los hemocultivos fue positivo en ≤ 62 h de incubación. Conclusión: El 100% de sepsis por bacterias gramnegativas, grampositivas no SCoN y 90% de las ocasionadas por SCoN, son identificadas en los hemocultivos en las primeras 48 h, por lo cual podemos concluir que para descartar una sepsis, un período de incubación en hemocultivos de 48 h es suficiente.


Introduction: Sepsis is a major cause of neonatal morbidity and mortality. Objectives: To detect the time when the bacterial growth curve is evidenced in the blood sample inoculated blood cultures and comparing the times of bacterial growth between Gram negative and Gram positive bacteria, among the types of neonatal sepsis and identifying microorganisms more often isolated from preterm and term. Patients and method: A descriptive study. 114 positive blood cultures from 1,932 blood cultures taken from 01-May-2010 and 31-May-2014 were evaluated. Data were analyzed with Stata® 11.0. Results: 5.9% of blood cultures had bacterial growth. The median and interquartile range of Gram negative times of bacterial growth was 11 h (10-13 h), for Gram positive coagulase-negative Staphylococcus different (CoNS) 12h (12-18h) and CoNS 42h (36-44h). 95.8% of Gram positive and 96% of Gram negative, were the times of bacterial growth ≤ 24 h incubation, whereas the 100% CoNS was positive ≤ 62 h of incubation. Conclusion: 100% of sepsis by Gram negative and Gram positive no CoNS and 90% of those caused by CoNS are identified in blood cultures in 48 h, so we can conclude that to rule out sepsis, an incubation period of 48 h in blood cultures is sufficient.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Infant, Newborn , Bacteremia/diagnosis , Sepsis/diagnosis , Gram-Negative Bacteria/isolation & purification , Gram-Positive Bacteria/isolation & purification , Staphylococcal Infections/diagnosis , Staphylococcal Infections/microbiology , Staphylococcus/isolation & purification , Staphylococcus/enzymology , Time Factors , Gram-Positive Bacterial Infections/diagnosis , Gram-Positive Bacterial Infections/microbiology , Gram-Negative Bacterial Infections/diagnosis , Gram-Negative Bacterial Infections/microbiology , Bacteremia/microbiology , Sepsis/microbiology , Blood Culture
18.
Rev. argent. microbiol ; 47(3): 190-195, set. 2015. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-843125

ABSTRACT

La identificación rápida de microorganismos es crítica, en especial en pacientes sépticos hospitalizados. La espectrometría de masas conocida como matrix-assisted laser desorption/ionization time-of- flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) permite la identificación directa desde botellas de hemocultivos positivos en forma rápida y sencilla. Este estudio evaluó el desempeño del procedimiento basado en el sistema MALDI Biotyper que utiliza el kit comercial MALDI Sepsityper de Bruker Daltonics (en adelante, MS) frente a uno artesanal (en adelante, HF). Se procesaron 840 botellas de hemocultivos positivos con HF y 542 de estas fueron evaluadas también con MS. Se logró la identificación de los microorganismos en 670 (79,76 %) y 391 (72,14 %) botellas, respectivamente (p = 0,0013). Se demostró la efectividad de ambos procedimientos para la identificación de microorganismos desde frascos de hemocultivos positivos. Sin embargo, el procedimiento HF fue superior al MS, en especial frente a bacterias gram positivas.


Rapid identification of microorganisms is critical in hospitalized infected patients. Blood culture is currently the gold standard for detecting and identifying microorganisms causing bacteremia or sepsis. The introduction of mass spectrometry by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF MS) in microbiology laboratories, especially in microorganisms growing in blood culture bottles, provides rapid identification. This study evaluates the performance of the Maldi Sepsityper Biotyper procedure (hereinafter, MS) compared to that of an in-home method (hereinafter, HF). Eight hundred and forty (840) positive blood culture bottles were processed using the HF procedure, 542 of which were also processed using MS. The organisms were identified in 670 (79. 76 %) and 391 (72. 14 %) bottles respectively (p = 0,0013). This study demonstrates the effectiveness of both procedures for identifying microorganisms directly from positive blood culture bottles. However, the HF procedure proved to be more effective than MS, especially in the presence of Gram positive organisms.


Subject(s)
Mass Spectrometry/methods , Bacterial Infections/classification , Laboratory and Fieldwork Analytical Methods/analysis , Blood Culture/statistics & numerical data , Mass Spectrometry/statistics & numerical data , Bacterial Infections/blood , Effectiveness , Diagnostic Techniques and Procedures/classification
19.
Kasmera ; 43(1): 16-33, jun. 2015. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-780174

ABSTRACT

Las infecciones del torrente sanguíneo causan una importante morbi-mortalidad en todo el mundo. Para conocer la incidencia de los principales microorganismos aislados de hemocultivos y su resistencia antimicrobiana en un hospital universitario, se revisaron los informes de 31.486 hemocultivos procesados desde enero de 2008 a diciembre de 2012. El porcentaje de hemocultivos positivos fue de 9,49%, el mayor número se obtuvo en las unidades de cuidados intensivos (36,22%). Se aislaron 3.054 microorganismos, 67,62% Gram positivos, 25,51% Gram negativos, 6,84% levaduras y 0,03% anaerobios estrictos. Los microorganismos predominantes fueron Staphylococcus coagulasa negativa, Staphylococcus aureus, Candida spp., Klebsiella pneumoniae, Enterococcus spp., Acinetobacter baumannii, Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa. Tanto S. aureus como las especies coagulasa negativa mostraron alta resistencia a oxacilina (72,0% y 88,9%, respectivamente) y sensibilidad a vancomicina. Un 26,4% de los enterococos (casi exclusivamente E. faecium) fueron resistentes a vancomicina. Acinetobacter baumannii y K. pneumoniae mostraron un alto porcentaje de resistencia a los antibióticos. En general, la mayoría de los microorganismos mostró un aumento progresivo de la resistencia a los antimicrobianos durante el quinquenio estudiado. Es necesario revisar y adecuar las políticas hospitalarias para el uso de antibióticos y reforzar las medidas de control del paciente infectado.


Bloodstream infections cause significant morbidity and mortality worldwide. To determine incidence of the main microorganisms isolated from blood cultures and their antimicrobial resistance in a university hospital, 31,486 blood culture reports processed from January, 2008, to December, 2012, were reviewed. The percentage of positive blood cultures was 9.49%; the highest number was obtained in intensive care units (36.22%). 3,054 microorganisms were isolated: 67.62% Gram positive, 25.51% Gram negative, 6.84% yeast and 0.03% strict anaerobes. The predominant organisms were coagulase-negative Staphylococcus, S. aureus, Candida spp., Klebsiella pneumoniae, Enterococcus spp., Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa. Both, S. aureus and the coagulase-negative species showed high resistance to oxacillin (72.0% and 88.9%, respectively) and sensitivity to vancomycin. A 26.4% of enterococci (E. faecium almost exclusively) were resistant to vancomycin. Acinetobacter baumannii and K. pneumoniae showed a high rate of resistance to the tested antibiotics. Overall, most of the microorganisms showed a progressive increase in antimicrobial resistance during the five years studied. It is necessary to review and adjust hospital policies for antibiotic use and strengthen control measures for the infected patient.

20.
Pediátr. Panamá ; 43(3): 8-17, Diciembre 2014.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-848644

ABSTRACT

El incremento en los últimos 10 años de los episodios de candidemia, la identificación de especies inusuales de Candida usando sistemas fenotípicos, la resistencia intrínseca y emergente en aislados clínicos a distintos antifungicos son elementos que nos conducen a realizar identificaciones más precisas y conocer los perfiles de susceptibilidad de las especies de Candida asociadas a fungemias. Objetivo: Realizamos una caracterización genotípica y fenotípica de los aislados clínicos de levaduras procedentes de muestras de hemocultivos de pacientes hospitalizados en el Hospital del Niño del periodo 2009 al 2010, para determinar la frecuencia de distribución las especies de Candida asociadas a fungemia y sus respectivos perfiles de susceptibilidad. Material y método: Se recolectaron un total de 55 cepas de Candida spp y levaduras relacionadas. Sólo se incluyó pacientes hospitalizados con hemocultivos positivos cuyo agente etiológico fueran levaduras y un sólo episodio por paciente, en las salas de Hemato-Oncología , Neonatología, Quemados, Medicina 6 y la Unidad de Terapia Intensiva del Hospital del Niño en el periodo de mayo 2009 a 2010. Se evaluaron 55 cepas, las cuales fueron identificadas usando el Vitek2, la prueba pagar harina de maíz y el método de PCR fingerprinter. Los patrones de bandas de los aislados clínicos fueron comparados con cepas de referencia para confirmar las identificaciones fenotípicas. Se realizaron pruebas de susceptibilidad para 6 antifúngicos de uso sistémico. Resultados: La distribución global final fue la siguiente: complejo de Candida parapsilosis (40%), Candida tropicalis (29.1%), Candida albicans (20%) Candida guilliermondi (3.6%), Sporobolomyces salmonicolor (1.8%), Saccharomyces cerevisiae (1.8%) y complejo Candida haemulonii (3.6%). Las especies del complejo C.parapsilolis presentó 6.3% resistencia a caspofungina y a itraconazol, mientras que C.albicans resultó con 18.2% de resistencia a caspofungina y anfotericina B, y 9.1% de resistencia a fluconazol, itraconazol y voriconazol. Algunas cepas de C.albicans fueron resistentes a varios antifúngicos. Conclusiones: A pesar de las limitaciones del sistema bioquímico automatizado Vitek2, resulta una herramienta útil para la identificación de los aislados clínicos de Candida app. Las pruebas de susceptibilidad usando el método de difusión con pagar Mullër Hinton dosificado resultó altamente confiable y reproducible. Candida parapsilosis fue la causa de fungemia en el Hospital del Niño durante el periodo de estudio. La resistencia a los distintos antifúngicos de los aislados clínicos de Candida spp. no excedió el 10% excepto por caspofungina.


Introduction: The increase in the last 10 years of episodes of candidemia, identification of unusual Candida species using phenotypic systems, intrinsic and emerging resistance in clinical isolates are different anti fungal elements that lead us to make more accurate identifications and knowing the profiles susceptibility of Candida species associated fungemia. Objetive: We do a genotypic and phenotypic characterization of clinical isolates of yeasts from blood cultures of hospitalized patients in the Hospital del Niño period 2009 to 2010 to determine the frequency distribution of Candida species associated with fungemia and their respective profiles susceptibility. Methods: A total of 55 strains of Candida spp and related yeasts were collected. Only hospitalized patients with positive blood cultures whose etiologic agent were yeasts and one episode per patient, in the halls of Hematology - Oncology, Neonatology, Burned, Medicine 6 and the Intensive Care Unit at Hospital del Niño between May 2009 included 2010. The 55 strains were evaluated, which were identified using the VItek2 system, Cornmeal agar test and PCR method fingerprinter. The banding patterns of clinical isolates were compared with reference strains to confirm phenotypic identifications. Susceptibility test were performed for 6 anti fungal for systemic use. Results: The global final distribution was as follows: Candida parapsilosis complex (40%), Candida tropical (29.1%), Candida albinas (20%), Candida gulliermondi (3.6%), Sporobolomyces salmonicolor (1.8%), Saccharomyces cerevisiae (1.8%), Candida complex haemulonii (3.6%). C.parapsilosis complex species showed 77.3% resistance to caspofungin and itraconazole 4.3%; C.tropicalis presented 6.3% resistance to caspofungin and itraconazole while C.albicans resulted with 18.2% resistance to caspofungin and amphotericin B, and 9.1% resistance to fluconazole, itraconazole and voriconazole. Some strains of C.albicans were resistance to several antifungal. Conclusions: Despite the limitations of automated biochemistry Vitek2 system, is a useful tool for identifying clinical isolates of Candida spp. Susceptibility tests using the agar diffusion method was dosed Muller Hinton highly reliable and reproducible. Candida parapsilosis was the main cause of fungemia in the Hospital del Niño during the study period. Resistance to antifungal different clinical isolates of Candida spp did not exceed 10% except for caspofungin.

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